水母“借光”
        上世纪90年代初，水母身上的一种绿色荧光蛋白给了钱永健灵感。他改造绿色荧光蛋白，通过改变其氨基酸排序，造出能吸收、发出不同颜色光的荧光蛋白，其中包括蓝色、黄色、橙色、红色、紫色等。科研人员使用光学显微镜，就可轻松确认基因或蛋白质活动的时间和位置。、
        由于绿色荧光蛋白用紫外线——照就发出鲜艳绿光，研究人员将绿色荧光蛋白基因插入动物、细菌或其他细胞的遗传信息之中，让其随着这些需要跟踪的细胞复制，可“照亮”不断长大的癌症肿瘤、观察有害细菌的生长。绿色荧光蛋白就仿佛是战争中随军做“嵌入”式报道的记者，让旁观生物学反应的研究人员像在电视旁追踪战争进程的观众一般，通过“现场直播”了解进展。
        通过给两种不同蛋白打上不同颜色的荧光标记，钱永健找到监测两种蛋白质相互作用的方法。凭借化学与生物方面的天分，钱永健找到了让绿色荧光蛋白更亮更持久发光的方法，并创造出了更广泛的荧光蛋白色彩。钱永健说：“我总是被色彩所吸引，当工作进展得不顺利时，因为色彩，我可以把工作继续进行下去。如果我天生是色盲，估计我不会取得今天的成就了。”正是色彩，让他的工作更有趣并进行新的探索。
        在谈到荧光蛋白的影响时，钱永健说：“整体而言，荧光蛋白对生物学许多领域产生巨大影响，因为它让科研人员把基因和他们所见到的细胞或器官内情况直接联系起来。”
        瞄准癌症
        钱永健一直想在临床方面做一些与他事业相关的事。不久前，他瞄准癌症成像和治疗，与同事研制出U形缩氨酸，用于承载成像分子或化疗药物。U形缩氨酸可成为某些蛋白酶和蛋白裂解酶的底物，这些酶从癌细胞中渗出，却极少出现在正常细胞中。当蛋白酶穿透U形缩氨酸底部时，u形缩氨酸的双臂会分离，其中一支臂拖住有效载荷部分进入隔壁细胞。
        在谈到自己将来的研究方向，钱永健强调，他接下来会继续自己的科研工作，“还有无穷无尽的工作要做”。钱永健的父亲和博士生导师都是因为得癌而死，所以，至于将来，他表示自己的终极挑战将是攻克癌症。